تضم دار الكتب مجموعات قيمة ونادرة من المقتنيات مثل : المخطوطات ، و المصاحف الشريفة، و البرديات التي تحفظ ثقافة هذه الأمة على مر العصور ، كما تعد ذاكرتها القومية.

تقتني دار الكتب مجموعة من أندر وأثمن المخطوطات كتبت باللغات العربية ،والتركية، والفارسية ؛ وهي في مختلف العلوم (دين- أدب – فلك - طب – تاريخ – جغرافيا - لغة ) ومن أهم المخطوطات العربية مجموعة المخطوطات الطبية التي تؤكد على مساهمة الحضارة العربية والإسلامية في العلوم الطبية منذ القدم مثل :

وتضمنت المخطوطات العربية أيضاً مجموعة من المخطوطات المختصة بالطب البيطري مثل: مخطوط كتاب البيطرة : الذي ركز مؤلفه على ذكر الخيول ونشأتها وعلاجها ،يقع المخطوط في ثلاثين باباً ، وبه سبع وثلاثين صورة لدواب مرضى ، وعلامات المرض، وعلاجها .

كما تضم المخطوطات العربية مجموعة من المخطوطات الجغرافية منها :